清政府放宽对民间设厂的限制主要是由于以下两个原因：
1. 财政危机：甲午战争后，清政府割地赔款，国库流失大量白银，面临严重的财政危机。为了支付巨额赔款，扩大税源，解决财政危机，清政府才放宽了对民间设厂的限制。
2. 帝国主义的侵略：甲午战争后，帝国主义的侵略和资本输出进一步破坏中国的自然经济，中国民族资本主义获得初步发展，民族资产阶级开始登上历史舞台。为了抵制帝国主义国家对中国进行的商品输出，清政府也放宽了对民间设厂的限制。
需要注意的是，清政府放宽对民间设厂的限制，既是迫于当时的局势，又是因为迫于经济问题。