明朝共有16位皇帝，但被称为“明十三陵”的原因是：其中两位皇帝葬在别处，一位皇帝下落不明，而其余十三位皇帝都葬在天寿山。具体来说，明朝开国皇帝朱元璋葬于南京钟山之阳的“明孝陵”，第二帝朱允炆（建文帝）下落不明，没有陵墓。第七帝朱祁钰被以“王”的身份葬于北京西郊玉泉山。因此，实际上并非所有明朝皇帝都葬在明十三陵，而是后人将葬在天寿山的十三位皇帝的陵墓统称为“明十三陵”。