蝶翼斑马鱼是卵生鱼类。它们在繁殖时，雄鱼追着雌鱼，等到雌鱼产卵后雄鱼再完成体外受精。一般雌雄比例为1:1或者2:1。繁殖力强，性成熟后亲鱼会自行繁殖。