南京违章停车的处罚标准如下：
1. 市内违停：驾驶人在场的情况下，交警可以指出违法行为并予以口头警告，令驾驶人立即驶离。一般情况下，只要驾驶人快速驶离，没有罚款扣分的处罚。如果驾驶人拒绝驶离，交警会对其处以20元以上200元以下罚款，不扣分，并开具“违法停车处理告知单”，贴到车辆窗户上。驾驶人不在场的情况下，交警部门除进行20元以上200元以下罚款贴罚单之外，还有权将该机动车拖移至不妨碍交通的地点或者南京公安机关交通管理部门指定的地点停放。
2. 高速公路违停：在南京高速公路上无故停车，或者在非紧急情况下在应急车道上停车，交警会对其处以罚款200元，扣6分的处罚。
需要注意的是，违章停车的罚款标准并不统一，每个城市都有自己的罚款标准。南京的车主可以使用相关网站或者微信公众号查询具体的违章停车罚款金额和扣分情况。