个人独资企业和个体工商户在交税上的主要区别在于个人独资企业需要缴纳个人所得税和企业所得税，而个体工商户只需要缴纳个人所得税。具体来说：
1. 个人独资企业：需要缴纳个人所得税和企业所得税。根据《国家税务总局关于〈关于个人独资企业和合伙企业投资者征收个人所得税的法规〉执行口径的通知》，个人独资企业可以享受一定的税收优惠，如残疾人员投资兴办或参与投资兴办个人独资企业和合伙企业的，可以申请减征个人所得税。
2. 个体工商户：只需要缴纳个人所得税。个体工商户的个人所得税一般是按营业收入带征（0.5%--2%之间），营业税或增值税也是按营业收入计算的。如果个体工商户是定额征收的话，营业额在月2万元以下的不用交营业税或增值税及其附加税费。
需要注意的是，无论是个人独资企业还是个体工商户，都需要按照税务机关的规定进行缴税，具体的税收政策可能会因地区和企业规模的不同而有所差异。