16岁打人致轻微伤被拘留后，一般不会留案底。因为轻微伤的情形，一般只会被治安管理处罚。打人者会拘留五日以上十日以下，情节较轻的，处五日以下拘留或者五百元以下罚款。行政拘留不会留案底。但是，被行政拘留的记录在公安机关的治安管理部门是可以查到的。