工藤新一变小的药丸名叫APTX4869。
这个药丸是《名侦探柯南》中的一种虚构药物，由黑衣组织的宫野志保（即灰原哀）研究出来。APTX4869的全称是APOPTOXIN4869，这个名字来源于APOTORCEISE（细胞自死）和TOXIN（毒素）两个词的组合。同时，4869在日文里和“夏洛克”谐音，这也是这个药物的寓意。
这个药本来应该是能直接致死，但因为是半成品，所以新一没死，而是变小。后来灰原哀想要逃离黑衣组织时也服下此药同样变小。