存款保险基金主要来源于以下几个方面：
1. 投保机构交纳的保费：商业银行、农村信用合作社、城市信用合作社、农村商业银行等金融机构需要按照一定费率缴纳存款保险费。其中，商业银行的存款保险费率为0.05%，其他金融机构的存款保险费率则根据其实际情况和经营风险等级来确定，但最高不能超过0.3%。
2. 在投保机构清算中分配的资产：当投保机构倒闭时，存款保险基金可以从清算过程中分配到一定的资产。
3. 存款保险基金管理机构运用存款保险基金获得的收益：存款保险基金管理机构可以通过运营存款保险基金获得一定的收益，如通过政府投资引导基金、银行业健康发展专项资金、利用存款保险基金收益、政府财政划拨等方式进行补充。
4. 其他合法收入：存款保险基金还可以通过其他合法途径获得收入。
需要注意的是，存款保险基金的费用由参与者即金融机构承担，存款人不需要额外支付任何费用。