是的，案件移交检察院会通知当事人。根据《刑事诉讼法》第一百七十六条，人民检察院自收到移送审查起诉的案件材料之日起三日以内，应当告知犯罪嫌疑人有权委托辩护人。侦查机关在第一次讯问犯罪嫌疑人或者对犯罪嫌疑人采取强制措施的时候，应当告知犯罪嫌疑人有权委托辩护人。因此，案件移交检察院时，会通知当事人本人。