六镇起义是北魏末年发生的一场重大历史事件，其影响主要体现在以下几个方面：
1. 导致北魏分裂：六镇起义最终导致北魏分裂，分别以宇文泰为首的西魏和高欢为首的东魏。这两方分别挟天子以令诸侯，建立了新的政权。北魏拓跋家失去了江山，内部持续百余年的汉化改革也因此中断。
2. 影响民族关系：六镇起义期间的河阴之变，导致魏国朝堂文武百官以及魏朝皇族等汉化核心被杀两千余口。后来的北周和北齐都是汉人改鲜卑姓说鲜卑话，直到杨坚掌权才扭转这种局面。
3. 延缓统一进程：六镇起义及以后的分裂战乱对北方的稳定和发展在一段时间内造成了不利影响，延缓了统一。然而，这也使得政治、经济、文化发生了新的整合，凝聚了新的力量，为结束持续了三百年的南北分裂局面和隋唐盛世奠定了坚实基础。