12小时两班倒工作制对身体的危害主要包括以下几点：
1. 免疫力下降：经常处于熬夜、疲劳、精神不振的状况，人体的免疫力会随之下降，容易感冒、胃肠感染、过敏等自律神经失调症状。
2. 睡眠不足：12小时两班倒工作制可能导致睡眠不足，从而影响第二天的工作效率和注意力集中。
3. 肠胃问题：熬夜加班的人容易感到疲劳，需要吃夜宵来恢复精力，但这可能对胃造成负担，因为胃黏膜上皮细胞的寿命很短，需要在夜间休息时进行修复。经常在夜间进餐可能导致胃肠道得不到必要的休息，影响胃黏膜的修复。
4. 精神压力：长时间的两班倒工作制可能导致精神压力增加，出现失眠多梦、精神不振等症状。
为了减轻这些危害，建议在日常生活中多注意休息，多吃营养价值高的食物，补充体内流失的营养成分，多锻炼身体，提高身体体质，加强免疫力。