三眼恐龙虾生活在池沼、水潭或水田等淡水中，特别是在气候温和年份的5-6月间肥水中，尤以水稻田中为多。它们在水底用前两对足爬行，有时几乎完全埋藏淤泥中，但也能很好地游泳。三眼恐龙虾既能滤食浮游生物和腐屑等，又能捕食各种小形动物（如水蚯蚓、摇蚊幼虫以及蛙卵、鱼卵等）。在水塘干涸时，它们会产下硬壳卵，等雨水来临时，便会迅速孵化，生长2-3周即可产卵。三眼恐龙虾的生命力强，已存在两亿年，被称为“活化石”。