红外光谱中的吸光度（Absorbance）和透过率（Transmittance%）是两个常见的纵坐标。吸光度表示样品对红外光的吸收量，而透过率（也叫百分透射比）是指红外光穿过样品时，剩余的光强和原有红外光强的比值。吸光度和透过率可以通过公式 A = Lg（1/T）互相转换，其中 A 是吸光度，T 是透过率。
如果需要在Origin软件中实现吸光度和透过率的换算，可以将红外数据导入到Origin中，然后使用公式进行计算。例如，如果需要将吸光度转换为透过率，可以选中一列空白列，右键单击→“SetColumnValues...”，然后在弹出的对话框中输入：10^(2-Col(B))，其中Col(B)指的是含有吸光度数据的那列。点击“OK”后，即可得到透过率数据。