宝可梦孵蛋个体值遗传遵循以下规则：子代的6项个体值随机从父母12项个体值中遗传3项，其中1项遗传自父方，1项遗传自母方，另一项随机遗传自任何一方。遗传技能只能从父方已掌握技能中选择（且需要符合遗传条件）。在孵蛋过程中，可以使用道具如不变之石道具锁定性格、保留地区形态，以及红线道具遗传父母五项个体值等。