口袋妖怪究极绿宝石5.5版本的金手指代码包括以下功能：
1. 穿墙功能：金手指代码为820052740001，可以让你的口袋妖怪无视建筑物的阻碍，轻松探索游戏地图的各个角落。
2. 刷钱功能：金手指代码为82005274FFFF，可以让你获得999，999个金币；另一个代码为82005274423F，可以让你获得65，535个金币。
3. 快速升级功能：金手指代码为8200527400XX，将XX替换成你想要的等级的十六进制值，例如01表示1级，64表示100级。
其他金手指代码包括大进化石、超级进化手链等功能。例如，大进化石的代码为82005274015C，路卡利欧的代码为015B，噬地鲨的代码为0138，耿鬼的代码为0155等。
在游戏中输入金手指代码时，按下L+R键，然后输入相应的代码。确保在输入代码之前保存游戏进度，以防止数据丢失。请注意，使用金手指代码可能会影响游戏的平衡性，建议谨慎使用。