南沙大桥的过桥费根据车型不同而有所差异。以1类车（≤7座以下车辆）为例，通过整座南沙大桥的费用为42元。2类车（8座到19座车）通过整座南沙大桥的费用为63元。货车则实行完全计重收费。南沙大桥的收费标准相对较高，这主要是为了弥补其建设和运营成本，实现合理的投资回报，以及控制车流量，避免拥堵和污染。