消逝的光芒2共有22个主线任务，分为20章。以下是主线任务列表：
1. 第一章至第七章（难度1）：漫游者之路、变得更强、瘟疫标记、唯一出路、任性的弟弟、抵达、袭击。
2. 第八章到第十一章（难度2）：水塔、革命、跳一曲华尔兹、家的港湾。
3. 第十二章到第十五章（难度3）：命令、天文台、欢迎上船、失落之灯。
4. 第十六章到第十八章（难度4）：广播、鞋子、夜行者。
5. 第十九章（难度5）：维罗妮卡。
6. 第20章（最终章）：突出重围、机不可失、X13。
每个主线任务在剧情任务前面会显示一个1-5的数字，数字越大，游戏的难度越大。其中难度4和5为最高难度模式。