在《烟雨楼》的大结局中，各个角色的命运如下：
1. 柳三变和林氏夫妇和好，毓秀终于得到了自由。烟雨楼成为传说中的地方，让人们留恋。
2. 李庆之，烟雨楼的楼主，最终开天门飞升而去，得道升仙获得了美好的结局。
3. 张邋遢，在小说中因为吞下了八仙之一铁拐李的烂腿上的疮盖后，成了一个半仙，后来在梦中学得了半仙的法术。但在后续的《烟雨楼续》中，张邋遢被包天笑杀害。
4. 男主最后回到了现实世界，他一朝穿越，生活在一个似正非正，似邪非邪的暗杀组织，在冷清秋的精心栽培下，一步步走向辉煌的巅峰。