在《疑犯追踪》中，部分主要人物的结局如下：
1. 根/Root：死了，被狙击枪打死。
2. 约翰·里瑟/John Reese：死了，被导弹炸死。
3. 哈罗德·芬奇/Harold Finch：受伤，最后去找他老婆了。
4. 萨姆恩·肖/Sameen Shaw：在给root报仇以后和那条狗在一起了。
5. 莱纳尔·弗斯科/Lionel Fusco：继续当警察。
在剧情中，芬奇、傅思科和肖在机器的庇佑下逃过一劫。芬奇在意大利和妻子相逢，里瑟和肖则继续维护正义，阻止犯罪。最后，撒马利亚人组织被完全摧毁，机器用自身存留下去的备份自我救赎，并再次承担起自己的责任。