《武士零》共有三个结局：金面具结局、银面具结局和隐藏BOSS结局。金面具结局中，主角死亡，但其他人可以活下来；银面具结局中，主角独自存活，其他所有人死亡，包括小女孩；隐藏BOSS结局中，主角存活，死的人会少几个。此外，游戏中还有一些隐藏结局，需要通过特定操作来触发。