英语PEP和精通版之间的区别主要有以下几点：
1. 教学内容不同：PEP版是人民教育出版社出版的英语教材，主要针对小学英语学生，从三年级开始使用。而精通版包含了各科内容，教学内容较为全面。
2. 教学要求不同：PEP版直属于中华人民共和国教育部的专业出版社，主要负责研究、编写、出版、发行基础教育教材和其他各类教材以及教育图书的任务。精通版则设有语文、数学、外语等20多个学科编辑室、课程材料研发中心。
3. 教材难易程度不同：PEP版小学英语三年级起点，以精彩的动画故事、童谣歌曲生动地展现了语言情境，让孩子看得愉快，学得轻松。而精通版从小学一年级到高中都有教材，贯穿整个学习生涯，难易程度则是从易到难。