番禺莲花山附近的地铁站是广州地铁4号线的石碁站和3号线的市桥站。乘客可以在这两个站下车，然后转乘莲花山专线公交车到达莲花山。
另外，乘客也可以在广州大基头、广州汽车站、广州东圃客运站及广州火车东站任一汽车站乘坐，到番禺市桥后，再转乘“市桥—莲花山”的汽车便可到达莲花山。