游戏王中难度较高的卡组有以下几种：
1. 十二兽：这个卡组需要玩家在有限的坑阻中做出合适的选择，同时面对不同的坑也需要立即作出判断止损。系统小导致投入大量系统外组件，并且没有刷坑做坑的手段，需要根据手牌和之后抽卡补充的手牌来决定采用什么样的战术。
2. DDD：这个卡组典型的高操作低收益，操作不熟练很容易说书超时。
3. 灵摆卡组：灵摆卡组的操作较为复杂，包括魔术师、月光等。
4. 恩底、闪刀、骚灵：这些卡组对操作也有一定要求。
需要注意的是，这些卡组的难度可能因个人喜好和熟练程度而有所不同。喜欢挑战的玩家可以尝试这些卡组，提高自己的游戏水平。