原核生物通常没有内含子，因为它们的基因表达过程中转录和翻译是同时进行的。然而，个别例外情况下，如鼠伤寒沙门氏菌、犬螺杆菌以及古生菌的rRNA和tRNA中都发现有内含子的存在。总的来说，原核生物中基因是连续编码的，没有外显子和内含子之分。