机顶盒刷机后遥控器不能用，可以尝试以下方法解决：
1. 重新对遥控器菜单进行配对。
2. 更换遥控器电池，电量低可能导致遥控器按键失效。
3. 在遥控器上找到一个小孔，在关机状态下使用细小的物体（如牙签）将其按下，按住几秒钟，然后松开，这将对遥控器进行软件复位操作。
4. 同时按住遥控器上的"机顶盒电源键"和数字键"1"保持8秒，指示灯有微亮变为快速闪烁后熄灭，代表切换为主用遥控器统一码值。
如果以上方法都无法解决问题，可能需要考虑更换一个新的遥控器。