手机设置拦截陌生电话后仍然能打进来的原因可能有以下几种：
1. 设置了拦截功能，但没有激活启用。个别品牌手机需要激活启用拦截功能。
2. 来电号码不在拦截设置范围，或者设置了同一号码重复来电不拦截。
3. 拦截软件的运行权限可能没开，即在后台没有运行拦截的软件。
4. 拦截阈值设置的过大，导致那些被标记次数比较少的骚扰电话还是能够正常接听。降低拦截阈值可以解决这个问题，但注意不可设置的过小，否则某些被恶意标记了几次的号码也会被拦截。
如果问题仍然存在，可以尝试直接使用运营商的来电拦截功能，或者更换手机进行拦截。