有机物命名官能团的优先级顺序如下：-COOH > -SO3H > -COOR > -COX > -CONH2 > -CN > -CHO > -CO -> -OH > -SH > -NH2 > -C三C -> -C=C -> -OR > -SR > -F > -Cl > -Br > -I > -NO2。
即：羧酸 > 磺酸 > 羧酸酯 > 酰卤 > 酰胺 > 腈 > 醛 > 酮 > 醇 > 硫醇 > 酚 > 硫酚 > 胺 > 炔烃 > 烯烃 > 醚 > 硫醚 > 卤代烃 > 硝基化合物。
当有机化合物含有多个官能团时，要以最优先的官能团为主官能团，其他官能团作为取代基。在确定官能团的优先级后，还需要确定取代基的位置和顺序，按照英文中名称的字母顺序进行排序。