伊斯兰教的极端化主要源于以下几个原因：
1. 社会经济因素：伊斯兰教的复兴运动始于20世纪70年代，与二战后伊斯兰世界发生的极大变化、以及整个伊斯兰世界对于社会转型期所遇到的问题的看法有关。伊斯兰复兴运动既有宗教领域的复兴要求，也有政治、文化、经济、社会等不同领域的民族和复兴要求。这些问题与宗教问题很难截然分开，甚至纠缠在一起，这就使伊斯兰复兴的过程呈现出复杂性、多样性，甚至极端化的发展。
2. 宗教差异和冲突：伊斯兰教与其他宗教，特别是西方文明之间存在差异、矛盾和冲突。伊斯兰教极端主义是产生于伊斯兰教内部的一股极端思潮，他们以歪曲的伊斯兰宗教世界观、宗教价值观来观察问题、对待问题和处理问题。
3. 宗教极端主义：宗教极端主义曲解宗教教义、伤害宗教的世界形象、挑起宗教矛盾和地区冲突，最终结果是危害到自身。这样的例子在历史上比比皆是，已经为伊斯兰教提供了充分的教训。
但需要注意的是，伊斯兰教的极端主义并不等同于伊斯兰教本身，主流穆斯林否认极端主义为伊斯兰思想。