差速离心法和密度梯度离心法在原理和应用中有以下主要区别：
1. 原理：差速离心法是通过交替使用低速和高速离心，用不同强度的离心力使具有不同质量的物质分级分离的方法。而密度梯度离心法是在密度梯度介质中进行的依密度而分离的离心法，各组分会依其密度分布在与其自身密度相同的液层中。
2. 应用：差速离心法适用于混合样品中各沉降系数差别较大组分的分离，而密度梯度离心法可用于分析型或制备型的离心分离。
3. 离心转速：密度梯度离心只用一个离心转速，而差速离心用两个甚至更多的转速。
4. 样品处理量：差速离心法的优点是样品的处理量较大，可用于大量样品的初分离。
5. 分离效果：密度梯度离心法具有良好的分辨力，可以同时使样品中几个或全部组分分离。
6. 操作繁杂程度：差速离心法的缺点是分离复杂样品和要求分离纯度较高时，离心次数多，操作繁杂。