污水处理大肠杆菌标准根据不同场所和排放标准有所不同。对于传染病、结核病医疗机构，大肠杆菌菌群数不得高于100MPN/L。对于综合医疗机构或其他医疗机构，如果直接排放到自然界，执行污水排放标准，大肠杆菌菌群数不得高于500MPN/L。如果排入市政管网，执行预处理标准，大肠杆菌菌群数不得高于5000MPN/L。对于城镇生活生产污水处理厂，根据《城镇污水处理厂污染物排放标准》（GB18918-2002），出水中粪大肠菌群的排放标准为1.0×104个/L。特殊场所，如医院、食品加工厂、养殖场等，其要求和标准会更加严格，需要根据具体行业及地方标准来确定废水中粪大肠菌群的标准。