美的净水器三个灯闪烁可能有以下几种原因：
1. 净水器出现断电或者停电状况，当净水器的电源出现故障时指示灯就会打开闪烁。
2. 净水器的低压开关出现故障，低压开关出现故障会导致净水器显示过压，启动保护装置，此时净水器就会开始暂停制水。
3. 净水器的水位控制器出现故障，如果净水器出现故障会导致无法制水，指示灯也会闪烁。
4. 净水器的高压泵失压，这可能是净水器的前置滤芯出现堵塞状况，可能是有废水或者杂物导致的，逆止阀堵塞也会导致指示灯闪烁。
5. 滤芯安装不正确或需要更换。
6. 电源接触不良或电池的使用寿命已经到头了。
如果确定所有的阀门都已关闭，然后将电源拔出，按住红色绿色蓝色三个按键不放，并插入电源线，等待三个按键同时闪烁时松开手指，净水器将会进入复位模式并自动运行冲洗程序，这个过程需要持续15分钟。在冲洗结束后，净水器就会回到初始状态并可以正常使用了。
如果问题依然存在，建议您检查一下使用时间是否已经超过滤芯的使用寿命或者拆下滤芯进行清洗，如果问题依然存在，可以联系美的售后服务进行咨询或维修。