继发性主动转运与原发性主动转运的区别主要有以下几点：
1. 能量来源不同：原发性主动转运的能量来源是ATP的直接分解，而继发性主动转运的能量来源是间接利用ATP分解。
2. 机制不同：原发性主动转运主要有钠泵、氢泵、钙泵等，通过Na+-K+-ATP酶（钠泵）进行。继发性主动转运如葡萄糖、氨基酸在小肠黏膜上皮的主动吸收等。
3. 方式不同：原发性主动转运是物质逆浓度梯度和（或）电位梯度的跨膜转运方式，而继发性主动转运是物质能够逆浓度差进行跨膜运输，但其能量不是来自于ATP分解，而是由主动转运其他物质时造成的高势能提供。
4. 研究内容不同：原发性主动转运研究最清楚的是钠泵，而继发性主动转运研究最清楚的是ATP。