枯草芽孢杆菌和大肠杆菌的主要区别有以下几点：
1. 枯草芽孢杆菌是革兰氏阳性菌，而大肠杆菌是革兰氏阴性菌。
2. 枯草芽孢杆菌能产生芽孢，而大肠杆菌不能产生芽孢。
3. 枯草芽孢杆菌是好氧菌，而大肠杆菌是兼性厌氧菌。
4. 枯草芽孢杆菌的单个细胞大小为0.7～0.8×2～3微米，着色均匀，无荚膜，周生鞭毛，能运动，芽孢0.6～0.9×1.0～1.5微米，椭圆到柱状，位于菌体中央或稍偏，芽孢形成后菌体不膨大，菌落表面粗糙不透明，污白色或微黄色。
5. 大肠杆菌是人和动物肠道中最著名的一种细菌，主要寄生于大肠内，约占肠道菌中的1%，是一种两端钝圆、能运动、无芽孢的革兰氏阴性短杆菌。