博德之门3在使用mod的情况下可以联机，但是有一些注意事项。
1. 如果双方使用的是不同的mod，联机时画面会显示不同mod设定，无法联机。解决方法是取消模组，或者让其他人也装上一样的模组。
2. 如果想在不同模组的情况下联机，可以打一个不同模组可联机的mod，但是可能导致游戏不稳定。
具体的联机步骤如下：
1. 打开游戏，在设置中选择联机设置，勾选在线游戏可见性。
2. 设置好之后，在首页点击进入多人联机模式。
3. 在联机大厅中，可以选择创建或加入好友的房间。
4. 邀请朋友加入游戏，好友会在Steam好友聊天信息中收到邀请信息，点击进行游戏即可进入联机房间。