有机化合物命名时官能团的优先次序如下：羧酸衍生物、醛、酮、碳碳双键、三键、取代基的卤素和硝基等。需要注意的是，在命名时，应遵循以下约定：优先考虑表示立体构型的前缀、优先考虑羰基（C=O）而不是羟基（-OH）、优先考虑烷基而不是卤素基、当命名时有多个相同的取代基或亚基时，应使用数字来表示它们在分子中的位置。