明日方舟开服时的主线有五章。目前，游戏已经开放了第五章，分别是第一章的十二关，第二章的十关，第三章的八关，第四章的十关以及第五章的十关。需要注意的是，剧情剧本可以内部调整增加，后续可能会随着更新增加更多章节。