恩格勒系统是德国著名植物学家恩格勒（A.Engler）和柏兰特（R.Prantl）于1897年在《植物自然分科志》一书中发表的，是分类学史上第一个比较完整的自然分类系统。
恩格勒系统将植物分成13门，前12门为孢子植物，第13门为种子植物门（又称有管有胚植物、显花植物），下分裸子植物和被子植物亚门。其中，裸子植物亚门包括科得狄纲、本内苏铁纲、苏铁纲、银杏纲、松柏纲、买麻藤纲等6纲。被子植物亚门包括2纲，55目，304科。单子叶植物纲包括11目，45科。双子叶植物纲包括2亚纲，44目，259科。
在恩格勒系统中，植物的分类是根据假花说的原理，认为无瓣花、单性化、风媒传粉、木本等性状是原始的特征；认为有花瓣、两性花、虫媒传粉是进化的特征。因此，把柔荑花序类植物（如胡桃科、壳斗科、木麻黄科等）当作被子植物中最原始类型，而把木兰科、毛茛科等看作是较进化的类型。